誰(shuí)也不曾想過(guò)七十年前那期神秘的羅斯威爾事件時(shí)至今日仍對(duì)全體人類產(chǎn)生著如此巨大的影響并且鮮少有人窺見真相的全貌即使它就在那里某天過(guò)著頹廢生活的前聯(lián)邦探員福克斯·穆德（大衛(wèi)·杜楚尼 David Duchovny 飾）以及他最為信賴的搭檔——正在某某教會(huì)醫(yī)院擔(dān)任醫(yī)師的丹娜·斯科莉（吉蓮·安德森 Gillian Anderson 飾）重新聚在一起原來(lái)一檔旨在揭露政治黑幕節(jié)目的主持人找到他們希望二人披露政客利用外星人來(lái)控制人類的真相以此為契機(jī)關(guān)閉已久的X檔案重新開啟一度對(duì)各種離奇事件失去信心的穆德在斯科莉的陪伴下重新踏上征程 　　而這一路上層層隱藏起來(lái)的真相以及人類可怕的未來(lái)將相繼呈現(xiàn)在他們的眼前……